Výzkumná skupina Mikrobiologie

Výzkumná skupina mikrobiologie propojuje základní a aplikovaný výzkum v oblasti veterinární, klinické a environmentální mikrobiologie. Naše práce pokrývá široké spektrum témat od identifikace a charakterizace mikroorganismů po vývoj inovativních antimikrobiálních látek a zkoumání antibiotické rezistence. Využíváme kombinaci klasických kultivačních metod a pokročilých molekulárních přístupů, včetně multi-omických technologií, genomiky, metagenomiky, metabolomiky a syntetické biologie.

Zaměřujeme se na porozumění buněčným mechanismům souvisejícím s rezistencí a virulencí patogenů, studujeme vliv faktorů prostředí na bakterie a zkoumáme mikrobiom v různých typech vzorků. Naše výzkumy mají aplikovatelné výstupy v oblasti medicíny, veterinární praxe, biotechnologie a ochrany životního prostředí. Klíčovým prvkem naší práce je interdisciplinární spolupráce, která nám umožňuje hledat inovativní řešení a nové přístupy k mikrobiologickému výzkumu.

Součástí Výzkumné skupiny jsou dvě laboratoře:

  1. Laboratoř aplikované mikrobiologie
  2. Laboratoř mikrobiální genomiky a ekologie

Doc. RNDr. Monika Dolejská, Ph.D.

Vedoucí výzkumné skupiny mikrobiologie
Akademická pracovníce – docentka

Kontakt

Email: monika.dolejska@mendelu.cz
Research ID: H-1555-2014
Orcid: 0000-0001-7877-483X

Členové týmu

  • Doc. RNDr. Monika Dolejská, Ph.D.
  • prof. Ing. Luděk Žůrek, Ph.D.
  • Ing. Kristýna Číhalová, Ph.D.
  • Mgr. Kristýna Hrazdilová, Ph.D.
  • Ing. Kristýna Šmerková, Ph.D.
  • Mgr. Petra Vídeňská, Ph.D.
  • RNDr. Stanislava Bezdíček Králová, PhD.
  • Mgr. Martina Coufalová
  • Ing. Denisa Fenclová
  • Ing. Nora Witkovská

Významná ocenění:

  • Stanislava Bezdíček Králová: Ocenění za nejlepší poster „“From Extreme Environments to Bioactive Discoveries: Unveiling the Potential of Antarctic Bacteria“, 5th European Conference on Natural Products, Německo (2024)
  • Stanislava Bezdíček Králová: Ocenění Young Blood Award od týdeníku Euro, Česká republika (2023) https://www.olmerad.cz/post/olmerad-na-cele-vyjimecneho-oceneni-young-blood-awards-2023
  • Stanislava Bezdíček Králová: Cena kreativních hrdinů od Creative Heroes Award od Nizozemsko-české obchodní komory, Česká republika (2022) https://cenakreativnichhrdinu.cz/yearbook-2023/
  • Stanislava Bezdíček Králová: Cena mladý český a slovenský mikrobiolog 2020, Česká republika https://ccm.sci.muni.cz/o-nas/aktuality/cena-mlady-cesky-a-slovensky-mikrobiolog-2020
  • Stanislava Bezdíček Králová: Cena děkana za publikaci vynikajících výsledků vlastního bádání, Přírodovědecká fakulta, Masarykova univerzita, Česká republika (2019) https://www.sci.muni.cz/clanky/ceny-dekana-2019
  • Monika Dolejská: Čestné uznání Ministra zdravotnictví za zdravotnický výzkum a vývoj pro rok 2019
  • Monika Dolejská: Ocenění Pro ženy ve vědě 2018 společnosti L’Oréal-UNESCO, Česká Republika, https://www.novinky.cz/clanek/zena-styl-oceneni-pro-zeny-ve-vede-ziskaly-vedkyne-zkoumajici-rakovinu-a-antibiotickou-rezistenci-18083
  • Monika Dolejská: Uznání rektora za reprezentaci VFU Brno v oblasti vědy a za mimořádné výsledky ve výzkumné činnosti v oblasti antibiotické rezistence (2018)
  • Monika Dolejská: Cena rektora za rozvoj Veterinární univerzity Brno a výzkumný přínos k vzdělávání, vědě a výzkumu (2013)
  • Monika Dolejská: Cena Předsedy Grantové agentury České republiky za rok 2013, projekt „Charakterizace koliformních bakterií rezistentních k cefalosporinům a hodnocení rizika použití antimikrobiálních látek na jejich selekci“, https://gacr.cz/cena-predsedy-grantove-agentury-charakterizace-koliformnich-bakterii-rezistentnich-k-cefalosporinum-a-hodnoceni-rizika-pouziti-antimikrobialnich-latek-na-jejich-selekci/
  • Monika Dolejská: Cena společnosti pro lékařskou mikrobiologii za mimořádné publikační výstupy (2013)
  • Kristýna Šmerková: Čestné uznání za vynikající řešení individuálního projektu IGA AF MENDELU s názvem „Sledování PCR produktů moderními biofyzikálními metodami“ v rámci projektu „Excelence doktorského studia na AF MENDELU pro navazující evropskou vědecko-výzkumnou kariéru“ (2013)
  • Kristýna Šmerková: Ocenění na mezinárodní konferenci Mendelnet 2013 v sekci Aplikovaná chemie a biochemie za práci „Fluorescence properties of quantum dots“
  • Kristýna Šmerková: Ocenění za nejlepší vědeckou publikaci s názvem s prací “Investigation of interaction between magnetic silica particles and lambda phage DNA fragment” v rámci projektu „Excelence doktorského studia na AF MENDELU pro navazující evropskou vědecko-výzkumnou kariéru” (2013)
  • Kristýna Šmerková: Ocenění za nejlepší poster „Optimization of DNA isolation using magnetic microparticles“, pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků (2012)
  • Kristýna Šmerková: Ocenění na mezinárodní konferenci Mendelnet v sekci Aplikovaná chemie a biochemie za práci prací „Sledování interakce platinových léčiv s DNA pomocí Sangerova sekvenování“ (2012)
  • Monika Dolejská: Cena děkana za významné výsledky doktorského studia, Fakulta veterinární hygieny a ekologie, Veterinární univerzita Brno (2010)

 

Projekty

  • GAČR: Studium diverzity ribozomálně syntetizovaných přírodních látek produkovaných antarktickými extremofily (GA25-17343S), 2024-2027
  • Mendelu, GA GJM A: Dynamika mikrobiomu mléčné žlázy skotu před nástupem a v průběhu mastitidy a vývoj nových typů antibakteriálních látek pro její léčbu, 2024-2027
  • Mendelu, IGA IP 2025: Inovativní antibakteriální nanočástice zaměřené proti biofilmu pro boj s multirezistentními stafylokokovými infekcemi způsobujícími bovinní mastitidu (IGA25-AF-IP-021), 2025
  • Mendelu Igráček (GA25-17343S (2024-2027): Multi-omics approach to study effects of agriculturally-used zinc on Escherichia coli: Risks assessment of bacterial resistance evolution, 2021-2022

Publikace

  • Izquierdo-Rodriguez, E., Hrazdilová, K., Anettová, L., Šipková, A., Coufal, R., Modrý, D., & Foronda, P. (2024). Co-introduction into a delicate island ecosystem: metastrongyloid nematodes (superfamily Metastrongyloidea) of veterinary and medical importance circulating in aquatic and terrestrial environments of Tenerife (Canary Islands). Parasitology Research, 123, Article 344. https://doi.org/10.1007/s00436-024-08364-1
  • Kosaristanova, L., Bytesnikova, Z., Fialova, T., Pekarkova, J., Svec, P., Ondreas, F., Jemelikova, V., Ridoskova, A., Makovicky, P., Sivak, L., Dolejska, M., Zouharova, M., Slama, P., Adam, V., & Smerkova, K. (2024). In vivo evaluation of selenium-tellurium based nanoparticles as a novel treatment for bovine mastitis. Journal of Animal Science and Biotechnology, 15(1), 17. https://doi.org/10.1186/s40104-024-01128-y
  • Rihacek, M., Kuthanova, M., Splichal, Z., Adam, V., Hrazdilova, K., Vesely, R., Zurek, L., & Cihalova, K. (2023). Escherichia coli from human wounds: Analysis of resistance to β-lactams and expression of RND efflux pumps. Infection and Drug Resistance, 16, 7365–7375. https://doi.org/10.2147/IDR.S435622
  • Lesiczka, P.M., Hrazdilová, K., Hönig, V., Modrý, D., & Zurek, L. (2023). Distant genetic variants of Anaplasma phagocytophilum from Ixodes ricinus attached to people. Parasites & Vectors, 16, Article 80. https://doi.org/10.1186/s13071-023-05654-y
  • Kralova, S., Davidova-Gerzova, L., Valcek, A., Bezdicek, M., Rychlik, I., Rezacova, V., Cizek, A. (2022). Paraphocaeicola brunensis gen. nov., sp. nov., carrying two variants of nimB resistance gene from Bacteroides fragilis, and Caecibacteroides pullorum gen. nov., sp. nov., two novel genera isolated from chicken caeca. Microbiology Spectrum. https://doi.org/1128/spectrum.01954-21
  • Kralova, S.¥, LaFrentz, B.R.¥, Burbick, C.R., Alexander, T.L., Phillips, C.W., Griffin, M.J, Waldbieser, G.C., García, J.C., de Alexandre Sebastião, F., Soto, E., Loch, T.P., Liles, M.R., Snekvik, K.R. (2021) The fish pathogen Flavobacterium columnare represents four distinct species: Flavobacterium columnare, Flavobacterium covae sp. nov., Flavobacterium davisii sp. nov. and Flavobacterium oreochromis sp. nov., and emended description of Flavobacterium columnare. Systematic and Applied Microbiology. ¥authors contributed equally to this work. https://doi.org/1016/j.syapm.2021.126293
  • Rihacek, M., Kosaristanova, L., Fialova, T., Rypar, T., Sterbova, D.S., Adam, V., Zurek, L., Cihalova, K. (2024). Metabolic adaptations of Escherichia coli to extended zinc exposure: insights into tricarboxylic acid cycle and trehalose synthesis. Bmc Microbiology;24(1); doi: 10.1186/s12866-024-03463-6.
  • Rihacek, M., Kosaristanova L., Fialova T., Kuthanova M., Eichmeier A., Hakalova E., Cerny M., Berka M., Palkovicova J., Dolejska M., Svec P., Adam V., Zurek L., Cihalova K. (2023). Zinc effects on bacteria: insights from Escherichia coli by multi-omics approach. mSystems 0(0): e00733-00723. https://doi.org/10.1128/msystems.00733-23
  • Younis, A.B., Milosavljevic, V., Fialova, T., Smerkova, K., Michalkova, H., Svec, P., Antal, P., Kopel, P., Adam, V., Zurek, L., Dolezelikova, K. (2023). Synthesis and characterization of TiO2 nanoparticles combined with geraniol and their synergistic antibacterial activity. Bmc Microbiology 23(1). https://doi.org/10.1186/s12866-023-02955-1
  • Palkovicova, J., Sukkar, I., Delafuente, J., Valcek, A., Medvecky, M., Jamborova, I., Bitar, I., Phan, M.D., San Millan, A., Dolejska, M. Fitness effects of blaCTX-M-15-harbouring F2:A1:B- plasmids on their native Escherichia coli ST131 H30Rx hosts. (2022) Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 77(11):2960-2963. https://doi.org/10.1093/jac/dkac250