Výzkumná skupina biomarkerů

Výzkumná skupina se specializuje na výzkum a vývoj inovativních bioanalytických přístupů
pro analýzu biomolekul (biomarkerů), prostřednictvím jednak analytických technik „zlatého
standardu“ (kapalinová chromatografie, hmotnostní spektrometrie) a výzkumem a
vývojem inovativních postupů s využitím magnetické separace s elektrochemickými a
optickými formami detekce s aplikací pro molekulárně diagnostické a imunodiagnostické
účely. Inovativní metody a techniky integruje v rámci výzkumu a navazujícího vývoje
pokrývající TRL 1-6 (Technology readiness level) do plně funkčních zařízení použitelných pro
kvalitativní a kvantitativní analýzu v místě potřeby (Point Of Need). Mezi hlavní oblasti zájmu
patří humánní, veterinární a environmentální aplikace.

Vedoucí výzkumné skupiny biomarkerů a biosenzorů
doc. RNDr. Ondřej Zítka, Ph.D.
Akademický pracovník – docent

Kontakt
E-mail: ondrej.zitka@mendelu.cz
Researcher ID: E-1107-2012
ORCID: 0000-0001-7607-5058
Scopus ID: 14012648400

Životopis
Curriculum Vitae

 

Členové týmu:

  • Ing. Jiří Kudr, Ph.D.
  • Mgr. Roman Guráň, Ph.D.
  • Ing. Tomáš Do, Ph.D.
  • Ing. Žaneta Buchtová, Ph.D.
  • Ing. Petra Stejskalová (roz. Vopařilová), Ph.D.
  • Ing. Karel Snášel
  • Ing. Lada Ilieva (roz. Šmídová ) (mateřská dovolená)
  • Ing. Silvia Vaculčiaková
  • Ing. Lucie Komárková
  • Ing. Michaela Heinzka
  • Bc. Adéla Bajková
  • Bc. Adéla Pojezná
  • Bc. Karolína Majkusová
  • Bc. Gabriela Štrajtová
  • Bc. Lucie Zajícová
  • Bc. Natálie Zgodová
  • Natálie Kobylíková
  • Tereza Novotná
  • Aneta Mičková

O nás v médiích

Projekty

  • 2023-2026: FW01010052, APLIKACE v oblasti moderních imunodiagnostických
    technologií, spoluřešitel, dotace 15 000 tis. (40 804 tis.) Kč
  • 2023-2027: TN02000017, TAČR Národní Centrum Biotechnologií ve Veterinární Medicíně
    (NACeBiVet). Řešitel dílčího projektu – Vývoj veterinární diagnostické platformy Point-of-
    Need pro detekci patogenů s využitím LAMP technologie, dotace 8 700 tis. (19 800 tis.) Kč
  • 2021-2022: Bezpečnostní výzkum, MVČR (VI04000057), Velmi rychlý přenosný systém
    pro detekci SARS-CoV-2“. Spoluřešitel, dotace 4 700 tis. (14 700 tis.) Kč
  • 2020-2023: TAČR TREND (FW01010052), Vývoj nových laboratorních testů pro
    diagnostiku zánětu, sepse a kardiovaskulárních onemocnění na principu
    chemiluminiscenční analýzy na automatizovaných platformách, spoluřešitel, dotace
    21 800 tis. Kč
  • 2020-2022: TAČR TREND (FW01010202), Výzkum a vývoj inovativních řešení v
    laboratorní diagnostic, spoluřešitel, dotace 14 900 tis. Kč

Publikace

  • Hasso, M., Kudr, J., Zitka, J., Sileny, J., Svec, P., Svorc, Ľ. & Zitka, O. 2024. Proving the automatic benchtop electrochemical station for the development of dopamine and paracetamol sensors. Microchimica Acta, 191, 1-12.https://doi.org/10.1007/s00604-024-06454-6
  • Sun, A., Voparilova, P., Liu, X., Kou, B., Reznicek, T., Lednicky, T., Ni, S., Kudr, J., Zitka, O., Fohlerova, Z., Pajer, P., Zhang, H. & Neuzil, P. 2024. An integrated microfluidic platform for nucleic acid testing. Microsystems & Nanoengineering, 10, 1-14.https://doi.org/10.1038/s41378-024-00677-6
  • Peris-Diaz, M. D., Guran, R., Domene, C., De los Rios, V., Zitka, O., Adam, V. & Krezel, A. 2021. An integrated mass spectrometry and molecular dynamics simulations approach reveals the spatial organization impact of metal-binding sites on the stability of metal-depleted metallothionein-2 species. J. Am. Chem. Soc., 143, 16486-16501.DOI: 10.1021/jacs.1c05495
  • Kudr, J., Michalek, P., Adam, V. & Zitka, O. 2021. COVID-19: A challenge for electrochemical biosensors. TRAC-Trends Anal. Chem., 136, 1-9.https://doi.org/10.1016/j.trac.2021.116192
  • Peris-Diaz, M. D., Guran, R., Zitka, O., Adam, V. & Krezel, A. 2021. Mass spectrometry-based structural analysis of cysteine-rich metal-binding sites in proteins with MetaOdysseus R software. J. Proteome Res., 20, 776-785. https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jproteome.0c00651
  • Vanickova, L., Guran, R., Kollar, S., Emri, G., Krizkova, S., Do, T., Heger, Z., Zitka, O. & Adam, V. 2019. Mass spectrometric imaging of cysteine rich proteins in human skin. Int. J. Biol. Macromol., 125, 270-277.https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2018.11.272
  • Kudr, J., Klejdus, B., Adam, V. & Zitka, O. 2018. Magnetic solids in electrochemical analysis. TRAC-Trends Anal. Chem., 98, 104-113.https://doi.org/10.1016/j.trac.2017.10.023