Laboratoř metabolomiky a epigenetiky rostlin

Hlavní vizí laboratoře je zvládnutí techniky genového inženýrství, především systém Crispr/Cas9 a CRISPRi pro regulaci genové exprese. S ohledem na extrémní změny počasí a budoucí potravinové zdroje se laboratoř zabývá  tím, jakým způsobem malé RNA (miRNA, siRNA) a další epigenetické mechanismy ovlivňují biosyntézu sekundárních metabolitů.

Laboratoř metabolomiky a epigenetiky rostlin

 


Photo

Ing. Dalibor Húska, Ph.D.

Vedoucí laboratoře metabolomiky a epigenetiky rostlin
Akademický pracovník – odborný asistent


Telefon: 420 545 133 280
Adresa pracoviště: ÚCB AF, Zemědělská 1, 61300 Brno – Budova D
Označení kanceláře: BA02N2028
E-mail:

Členové týmu

  • Ing. Dalibor Húska, Ph.D.
  • Ing. Martina Koláčková, Ph.D.
  • Mgr. Olga Kryštofová, Ph.D.
  • M.Sc. Amitava Moulick, Ph.D.
  • Ing. Helena Novotná, Ph.D.
  • Mgr. Dagmar Štěrbová, Ph.D.
  • Ing. Libor Lenža
  • MSc. Sukanya Bhowmick
  • Ing. Markéta Dobešová
  • Mgr. Marek Dvořák
  • Ing. Pavel Chaloupský
  • Ing. Anna Jánová
  • M.Sc. Aninda Mazumdar
  • Ing. Ivan Rankic
  • M.Sc. Vishma Pratap Sur
  • Ing. Vladimíra Tarbajová
  • Ing. Radim Zelinka

Vypsaná témata disertačních prací

  • Volné téma – oblast nanočástice a rostliny
  • Volné téma – oblast genetického inženýrství rostlin/mikřas studium sekundárního metabolismu
  • Volné téma – oblast nanotechnologie v zemědělství
  • Volné téma – oblast nanomateriálů a mikrořas a biotechnologie
  • Optional topic

 

Projekty

  • Mendelu: Využití nanokompozitních materiálů při eliminaci dopadu stresu suchem a nadměrným ozářením v prostorech kukuřice seté. 2019-2020.

Publikace

  • Jelinkova, P.; Mazumdar, A.; Sur, V. P.; Kociova, S.; Dolezelikova, K.; Jimenez Jimenez, A. M.; Koudelkova, Z.; Mishra, P. K.; Smerkova, K.; Heger, Z.; Vaculovicova, M.; Moulick, A.; Adam, V.; Nanoparticle-drug conjugates treating bacterial infections. J. Control. Release 2019, 307, 166-185. DOI: 10.1016/j.jconrel.2019.06.013.
  • Kolackova, M.; Moulick, A.; Kopel, P.; Dvorak, M.; Adam, V.; Klejdus, B.; Huska, D.; Antioxidant, gene expression and metabolomics fingerprint analysis of Arabidopsis thaliana treated by foliar spraying of ZnSe quantum dots and their growth inhibition of Agrobacterium tumefaciens. J. Hazard. Mater. 2019, 365, 932-941. DOI: 10.1016/j.jhazmat.2018.11.065.
  • Strejckova, A.; Dvorak, M.; Klejdus, B.; Krystofova, O.; Hedbavny, J.; Adam, V.; Huska, D.; The strong reaction of simple phenolic acids during oxidative stress caused by nickel, cadmium and copper in the microalga Scenedesmus quadricauda. New Biotech. 2019, 48, 66-75. DOI: 10.1016/j.nbt.2018.07.004.
  • Jimenez Jimenez, A. M.; Moulick, A.; Bhowmick, S.; Strmiska, V.; Gagic, M.; Horakova, Z.; Kostrica, R.; Masarik, M.; Heger, Z.; Adam, V.; One-step detection of human papilloma viral infection using quantum dot-nucleotide interaction specificity. Talanta 2019, 205, 1-8. DOI: 10.1016/j.talanta.2019.07.006.
  • Milosavljevic, V.; Jamroz, E.; Gagic, M.; Haddad, Y.; Michalkova, H.; Balkova, R.; Tesarova, B.; Moulick, A.; Heger, Z.; Richtera, L.; Kopel, P.; Adam, V.; Encapsulation of Doxorubicin in Furcellaran/Chitosan Nanocapsules by Layer-by-Layer Technique for Selectively Controlled Drug Delivery. Biomacromolecules 2019, in press, . DOI: 10.1021/acs.biomac.9b01175 .
  • Vaneckova, T.; Bezdekova, J.; Tvrdonova, M.; Vlcnovska, M.; Novotna, V.; Neuman, J.; Stossova, A.; Kanicky, V.; Adam, V.; Vaculovicova, M.; Vaculovic, T.; CdS quantum dots-based immunoassay combined with particle imprinted polymer technology and laser ablation ICP-MS as a versatile tool for protein detection. Sci. Rep. 2019, 9, 1-9. DOI: 10.1038/s41598-019-48290-2.
  • Bacova, R.; Klejdus, B.; Ryant, P.; Cernei, N.; Adam, V.; Huska, D.; The effects of 5-azacytidine and cadmium on global 5-methylcytosine content and secondary metabolites in the freshwater microalgae Chlamydomonas reinhardtii and Scenedesmus quadricauda. J. Phycol. 2019, 55, 329-342. DOI: 10.1111/jpy.12819.
  • Gutierrez; Ansuategi; Susperregi,; Tub; Ranki; Lenza, L.; A benchmarking of learning strategies for pest detection and identification on tomato plants for autonomous scouting robots using internal databases. J. Sens. 2019, 2019, 1-15. DOI: 10.1155/2019/5219471.
  • Horky, P.; Skalickova, S.; Urbankova, L.; Baholet, D.; Kociova, S.; Bytesnikova, Z.; Kabourkova, E.; Lackova, Z.; Cernei, N.; Gagic, M.; Milosavljevic, V.; Smolikova, V.; Vaclavkova, E.; Nevrkla, P.; Knot, P.; Krystofova, O.; Hynek, D.; Kopel, P.; Skladanka, J.; Adam, V.; Smerkova, K.; Zinc phosphate-based nanoparticles as a novel antibacterial agent: in vivo study on rats after dietary exposure. J. Anim. Sci. Biotechnol. 2019, 10, 1-12. DOI: 10.1186/s40104-019-0319-8.
  • Vsiansky; Svobodova; Gumulec; Cernei, N.; Sterbova, D.; Zitka, O.; Kostrica, R.; Smilek; Plzak; Betka; Kalfert; Masarik, M.; Raudenska, M.; Prognostic significance of serum free amino acids in head and neck cancers. Cells 2019, 8, 1-12. DOI: 10.3390/cells8050428.
  • Sur, V. P.; Kominkova, M.; Buchtova, Z.; Dolezelikova, K.; Zitka, O.; Moulick, A.; CdSe QD biosynthesis in yeast using tryptone-enriched media and their conjugation with a peptide hecate for bacterial detection and killing. Nanomaterials 2019, 9, 1-15. DOI: 10.3390/nano9101463.
  • Jelinkova, P.; Vesely, R.; Cihalova, K.; Hegerova, D.; Ananbeh, H. A. A. A.; Richtera, L.; Smerkova, K.; Brtnicky, M.; Kynicky, J.; Moulick, A.; Adam, V.; Effect of arsenic (III and V) on oxidative stress parameters in resistant and susceptible Staphylococcus aureus. Environ. Res. 2018, 166, 394-401. DOI: 10.1016/j.envres.2018.06.024.
  • Sturikova, H.; Krystofova, O.; Huska, D.; Adam, V.; Zinc, zinc nanoparticles and plants. J. Hazard. Mater. 2018, 349, 101-110. DOI: 10.1016/j.jhazmat.2018.01.040.
  • Hynstova, V.; Sterbova, D.; Klejdus, B.; Hedbavny, J.; Huska, D.; Adam, V.; Separation, identification and quantification of carotenoids and chlorophylls in dietary supplements containing Chlorella vulgaris and Spirulina platensis using High Performance Thin Layer Chromatography. J. Pharm. Biomed. Anal. 2018, 148, 108-118. DOI: 10.1016/j.jpba.2017.09.018.
  • Jimenez Jimenez, A. M.; Moulick, A.; Richtera, L.; Krejcova, L.; Kalina, L.; Datta, R.; Svobodova, M.; Hynek, D.; Masarik, M.; Heger, Z.; Adam, V.; Dual-color quantum dots-based simultaneous detection of HPV-HIV co-infection. Sens. Actuator B-Chem. 2018, 258, 295-303. DOI: 10.1016/j.snb.2017.11.074.
  • Milosavljevic, V.; Haddad, Y.; Moulick, A.; Buchtelova, H.; Guran, R.; Pospisil, T.; Stokowa-So; Heger, Z.; Richtera, L.; Kopel, P.; Adam, V.; Functional analysis of novicidin peptide: Coordinated delivery system for zinc via Schiff base ligand. Bioconjugate Chem. 2018, 29, 2954. DOI: 10.1021/acs.bioconjchem.8b00370.
  • Moulick, A.; Heger, Z.; Milosavljevic, V.; Richtera, L.; Barroso; Merlos, M. A. R.; Buchtelova, H.; Podgajny, R.; Hynek, D.; Kopel, P.; Adam, V.; Real-time visualization of cell membrane damage using gadolinium Schiff base complex-doped quantum dots. ACS Appl. Mater. Interfaces 2018, 10, 35859-35868. DOI: 10.1021/acsami.8b15868.
  • Dostalova, S.; Polanska, H.; Svobodova, M.; Balvan, J.; Krystofova, O.; Haddad, Y.; Krizkova, S.; Masarik, M.; Eckschlager, T.; Stiborova, M.; Heger, Z.; Adam, V.; Prostate-specific membrane antigen-targeted site-directed antibody-conjugated apoferritin nanovehicle favorably influences in vivo side effects of doxorubicin . Sci. Rep. 2018, 8, 1-13. DOI: 10.1038/s41598-018-26772-z.
  • Buchtelova, H.; Strmiska, V.; Skubalova, Z.; Dostalova, S.; Michalek, P.; Krizkova, S.; Hynek, D.; Kalina, L.; Richtera, L.; Moulick, A.; Adam, V.; Heger, Z.; Improving cytocompatibility of CdTe quantum dots by Schiff-base-coordinated lanthanides surface doping. J. Nanobiotechnol. 2018, 16, 1-14. DOI: 10.1186/s12951-018-0369-7.
  • Jelinkova, P.; Splichal, Z.; Jimenez Jimenez, A. M.; Haddad, Y.; Mazumdar, A.; Sur, V. P.; Milosavljevic, V.; Kopel, P.; Buchtelova, H.; Guran, R.; Zitka, O.; Richtera, L.; Hegerova, D.; Heger, Z.; Moulick, A.; Adam, V.; Novel vancomycin–peptide conjugate as potent antibacterial agent against vancomycin-resistant Staphylococcus aureus. Infect. Drug Resistance 2018, 2018, 1807. DOI: 10.2147/IDR.S160975.